Έξι προγράμματα επαγγελματικής εκπαίδευσης ιδρύονται και θα λειτουργήσουν στο Κέντρο Επαγγελματικής Εκπαίδευσης (ΚΕΕ) του Ελληνικού Μεσογειακού Πανεπιστημίου, συναφών με το γνωστικό αντικείμενο Τμημάτων του ιδρύματος.

Πρόκειται για τα εξής προγράμματα:
1. Ηλεκτρικές Εγκαταστάσεις και Αυτοματισμοί (Τμήμα Ηλεκτρολόγων Μηχανικών TE του ΤΕΙ Κρήτης)
2. Τεχνικός Κηπευτικών Καλλιεργειών (Τμήμα Τεχνολόγων Γεωπόνων του ΤΕΙ Κρήτης).
3 Στέλεχος Οργάνωσης και Διοίκησης Επισιτιστικών Μονάδων (Τμήμα Διοίκησης Επιχειρήσεων του ΤΕΙ Κρήτης).
4. Υπάλληλος Οικονομικών Υπηρεσιών (Τμήμα Λογιστικής και Χρηματοοικονομικής του ΤΕΙ Κρήτης).
5. Συστήματα παραγωγής CAD/CAM/CNC (Τμήμα Μηχανολόγων Μηχανικών TE του ΤΕΙ Κρήτης).
6. Πολυμέσα και Διαδίκτυο (Τμήμα Μηχανικών Πληροφορικής TE του ΤΕΙ Κρήτης).